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乙型肝炎病毒基因分型的标签序列研究

2010-03-17 10:41:13 来源:中华肝病网 浏览:2317

乙型肝炎病毒基因分型的标签序列研究
蔡颖  李学成  吴小梅  王宁  曹红卫  卫国  赵苛岑  郑凯  郑江  李彦
【摘要】目的  快速、准确地鉴定HBV基因型,寻找基因型间特异性的序列标签。 方法  通过生物信息学手段,比对分析美国国立生物技术信息中心数据库中930条各型HBV基因组序列的大S区域,选择型间具有高度特异性的序列片段作为分型标签序列,以此设计引物,通过PCR实验对重庆地区的80例临床HBV阳性血清样本进行分型观察。 结果  HBV基因组大S区的149~169nt和461~483nt两段区域含有多个保守的型间差异位点;在8种基因型标签对构成的28种型组合中,27种组合的碱基总差异数均≥6;PCR实验和电泳结果证实,来自该两区段的序列标签引物能够获得特异性的产物,有效鉴定出HBV基因型。 结论  HBV基因大S区的149~169nt和461~483nt两段序列可作为HBV基因型分型标签序列,用作引物探针设计或测序标签。
【关键词】肝炎病毒,乙型; 基因型; 标签序列

Identification of HBV genotype-specific tag sequences    CAI Ying, LI Xue-cheng, WU Xiao-mei, WANG Ning, CAO Hong-wei, WEI Guo, ZHAO Ke-cen, ZHENG Kai, ZHENG Jiang, LI Yan. Department of Infectious Diseases, No.324 Hospital of PLA, Chongqing 400020, China

请您订阅《中华肝脏病杂志》2010年第18卷第2期,P101-104.获取全文内容。

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